Değerlendirme sürecini tamamlayan ve cerrahi adayı olarak görülen hastalar endoskopik işlem tamamlandıktan sonra ameliyathaneye alınır. Tüp mide, Ligasure ve Stapler cihazlarının kullanıldığı ve hastanın karnına dört küçük kesi yapıldığı, ortalama 45-50 dakika süren bir işlemdir. Mide anatomisine zarar vermemek için işlem sırasında mide hacminin yaklaşık 4/3’üne müdahale edilir. Mideyi kapatmak için zımba ve dikiş hatları kullanılır. Ortalama 2 saat süren ameliyathane süreci boyunca ve ameliyat sonrası hasta odasına transfer edilir. Genel olarak ameliyattan sonra yoğun bakım ünitesine ihtiyaç duyulmaz. Dördüncü saatten sonra hemşirelerin kalkmanıza yardımcı olmasıyla hareket işlemi başlar.